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最小体积矫正方法步骤-基于体素形态学测量(VBM)常用

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点击次数:1439 更新时间:2019年08月31日14:53:41 打印此页 关闭

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SPM8允许两种FDR校验。一个是voxel-wise FDR,另一个是拓扑学的(topological)FDR。

如果要做voxel-wise FDR 校验,就把spm_defaults里的68行(spm8)或79行(spm12)的defaults.stats.topoFDR中的1改为0

此时SPM8里的FDR按钮会出现。在SPM里点results,选FDR校验即可。

如果要做topological FDR 校验,就把defaults.stats.topoFDR设为1(默认是1)。

首先在SPM8里点results——None(无校验)——T threshold或p value(自己随意设,默认的0.001也可以)——extent threshold(默认0即可)。

然后在左下侧窗口点whole brain会得到results table。找到FDRc对应的值。然后再次点Results——None——T threshold或p value(输入上一次的值,例如上一次是0.001,这一次还是0.001)——extent threshold(输入FDRc对应的值)。这样得到的激活图就是cluster-wise FDR校验的结果,也就是topological FDR校验的结果。

SPM里面有peak-level FDR,见result table里面的FDRp,用FDRp对应的值作为height threshold得到的结果就是peak-level FDR的结果。用FDRc对应的值作为extent threshold得到的结果就是topological FDR(或cluster-wise FDR)的结果。

topological FDR是基于高斯随机场理论,认为voxel之间不是独立的,超过T threshold的voxel 构成了一个个cluster,然后对这些cluster进行FDR校验,这样独立单元(原来是voxel总个数,而现在就是cluster的个数)就大大减小了。这种校验的错误发现率是小于0.05的,不论T threshold 设为多大。而原来的voxel-wise FDR认为voxel之间是独立。而实际的fMRI数据经过平滑之后,voxel之间是不独立的,因此对于一个激活的脑区来说,用这种voxel-wise FDR校验得到的错误发现率就很高。

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